中醫(yī)古籍出版社由中國中醫(yī)研究院主辦，主要出版中醫(yī)古籍及研究中醫(yī)古籍的著作，承擔(dān)國家搶救行將失傳的有價值的中醫(yī)孤本、善本、珍本古籍的復(fù)制影印任務(wù)，同時也出版中醫(yī)理論、臨證各科、中藥、方劑針灸、養(yǎng)生等著作以及中醫(yī)藥工具書、中醫(yī)藥教材、醫(yī)學(xué)科普讀物等。

中國中醫(yī)藥典籍開展了系統(tǒng)的現(xiàn)代整理出版工程，推出了《中醫(yī)珍本叢書》、《珍本醫(yī)籍叢刊》、《影印文淵閣四庫全書醫(yī)家類》、《北京大學(xué)圖書館館藏善本醫(yī)書》等大型中醫(yī)古籍叢書，其中有大量險些流散的中醫(yī)孤本、善本、珍本古籍。

近10年來，中醫(yī)古籍出版社印制、發(fā)行中醫(yī)藥古籍、中醫(yī)藥古籍研究、中醫(yī)藥臨床研究、中醫(yī)藥教材和工具書以及中西醫(yī)結(jié)合科研、臨床、教學(xué)圖書，醫(yī)學(xué)科普圖書5000余種、約3500萬冊。一些重要的學(xué)術(shù)、專業(yè)圖書獲得全國古籍整理二等獎，全國優(yōu)秀科技圖書獎二、三等獎，中華中醫(yī)藥學(xué)會學(xué)術(shù)著作二、三等獎等部級獎勵。2010年，又榮獲第二屆中國出版政府獎圖書獎提名獎。